La guía del docente es un documento que acompaña el desarrollo del programa en aula. Tiene tres partes: La primera parte describe los fundamentos pedagógicos que sostienen el programa, la segunda parte brinda orientaciones sobre la actitud y los principios que debe considerar el docente en su práctica pedagógica para despertar el interés en los escolares por aprender ciencias. La tercera parte brinda indicaciones específicas para el desarrollo de cada una de las sesiones EXPERIMENTO considerando el método de indagación, en la que se visualiza la meta de aprendizaje, la pregunta central, las actividades de inicio, desarrollo y cierre.